哥倫比亞政府，因應冠狀病毒的出現，自2020年三月底即對哥倫比亞境內32個省份進行人流/車流管制、並實施宵禁來遏制病毒的傳播，這項管制影響了許多的經濟活動，且在四月中即將解禁時又無預警地延長了管制，目前暫定解禁日為5/11。但有34條特例，其中，針對民生必需品的流通，有相當程度放寬流動限制以確保衣食無虞。
咖啡莊園、乾/濕處理廠及中小型合作社或出口商（約占哥倫比亞咖啡75%交易量）等，都是可以運作的，但是因為國內對於其他產業管制(尤其物流運輸)，會有延誤的情況。最棘手的是，政府對於人員流動上的管制，對於咖啡在採收及乾處理等過程有重大的影響！人員只能在有限的範圍內工作，這對於莊園及處理廠是很大的考驗！最近市場上出現的缺貨現象，部分就是因為人員的短缺造成。順帶一提，哥倫比亞並沒有對進出口的貨品進行隔離管制，港口及機場對於貨品的進出口是正常運作的，對此，看法兩極。
另外，市場端的到貨延誤或是缺貨現象，來自於物流層面。
首先，往返哥倫比亞港口的貨物運輸服務供應減少，主要原因是運輸業者對過境路線上的安全、物資補給和住宿等出了問題（多國封城鎖國），所以只能以減少航班來解決。
再來，因為人員的管制，願意、或是能夠出勤的司機減少。由於在道路上行駛的車輛減少，司機和出口商對從產區或處理廠到港口的貨物盜竊率表示擔憂。儘管警察已經宣布了控制和安全措施，但還是增加了咖啡運送的困難度及成本。
最後，（空）貨櫃的流動不佳。咖啡的運輸是由產地裝櫃後送往港口出口，因為上述兩個原因造成很多的貨櫃無法如期到達目的地，所以就算咖啡已經裝櫃完成，也不見得有辦法可以送到港口，更不用提那些還在排隊等貨櫃的咖啡。
鑑於國內運輸貨物的困難，哥倫比亞政府頒布了第482號法令，統一協調涉及貨物動員的不同項目組合，例如農業和農村發展部，商業，工業和旅遊部以及交通運輸部，交通運輸部及其所有附屬部門 。
哥倫比亞的港口運營從未受到限制，因為政府一直在努力確保民生物資的供應鏈和食品安全不受影響。在物流方面，絕大部分是因為航班的取消造成，尤其由亞洲出發或是來自亞洲的航班。
總而言之，哥倫比亞咖啡是其重要的民生經濟作物，在生產及後製處理上沒有因為新冠病毒造成大短缺，反倒是因為運輸及其他必要條件的流通不佳及限制，造成了咖啡供應鏈的供應困難，但這些措施能幫助哥倫比亞將疫情盡可能地控制並渡過這非常時期。